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Synaptic Systems--FluoTag-X4抗GFP單結構域抗體與天然GFP信號高度相關

發布者:艾美捷科技    發布時間:2024-11-07     
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FluoTag-X4抗GFP單結構域抗體與天然GFP信號高度相關,在定量共定位方面優于傳統GFP抗體。

 

在以下方法中,應通過原生GFP信號與抗體染色信號的共定位研究來突出這一優勢。對轉基因小膠質細胞CX3CR1-GFP+/-小鼠(Jung等人,2000年)的腦切片進行了免疫組織化學染色,使用的是FluoTag?-X4抗GFP抗體或傳統的間接免疫染色。

 

通過合并圖片、散點圖和相關系數分析共定位

共定位可以在兩個熒光信號的合并圖片中可視化。原生GFP通道(綠色 - 圖1A,2A)和抗體染色通道(紅色 - 圖1B,2B)的重疊像素顯示為黃色(圖1C,2C)。合并圖片清楚地顯示,FluoTag?-X4抗GFP染色結果在微膠質細胞的不同區域產生了均勻的共定位,而傳統染色在微膠質細胞的不同區域產生了波動。細胞核顯示出明亮的原生GFP信號,但只有非常微弱的抗體染色(圖2A-C,星號),這可能是由于傳統抗體進入細胞核的穿透性較差或空間障礙所致。相比之下,微膠質細胞的突起與GFP信號相比,在抗體染色下顯得更亮(圖2A-C,箭頭),很可能是由于二級試劑的高放大作用。散點圖是另一種有用的工具,用于可視化共定位(ImageJ,Dunn等人,2011)。在這里,每個像素的顏色強度相互對比(圖1D,2D)。在高共定位的情況下,點會圍繞一條直線聚集,如圖1D中可以很好地看到。


使用單域FluoTag?-X4抗GFP抗體的直接免疫染色

圖1:使用單域FluoTag?-X4抗GFP抗體的直接免疫染色。

(A)原生GFP信號,

(B)FluoTag?-X4抗GFP抗體(AB)染色,

(C)合并圖片以及

(D)帶有皮爾遜相關系數(PCC)的散點圖。

圖2:使用傳統抗GFP抗體的間接免疫染色。

(A)原生GFP信號,

(B)傳統抗體(AB)染色,

(C)合并圖片以及

(D)帶有皮爾遜相關系數(PCC)的散點圖。

 

這兩種可視化方法,合并圖片和散點圖,都表明FluoTag?-X4抗GFP染色與原生GFP信號的相關性高于傳統染色。接下來,使用皮爾遜相關系數(PCC)量化了相關性,這是一個穩健的工具,不受增益或偏移的影響(ImageJ,Adler等人,2010,Bolte等人,2006)。如果完全正相關,PCC為1;如果沒有相關性,PCC為0。量化顯示,FluoTag?-X4抗GFP-At542與原生GFP信號的相關性令人印象深刻,PCC為0.9732(圖1D),而傳統間接抗體染色與原生GFP信號的相關性僅為0.7676(圖2D)。對每組三張圖片的分析確認了這一結果,具有高度的統計顯著性p<0.001。

 

這個實驗再次說明,小的直接結合的單域抗體具有單價結合特性,顯示出非常好的組織穿透性,并產生準確反映給定蛋白表達水平和分布的染色模式。它們不受二級試劑高放大作用的影響,這使得它們在定量共定位研究中優于傳統的間接免疫染色。

 

艾美捷Synaptic Systems 相關產品:

Cat.No.          Product Description

N0304-AF568-L    GFP sdAb,camelid,monoclonal,FluoTag-X4,AZdye 568

N0304-AF647-LGFP    sdAb,camelid,monoclonal,FluoTag-X4,Alexa 647

N0304-At488-LGFP    sdAb,camelid,monoclonal,FluoTag-X4,ATTO 488

 

文獻參考:

Adler et al., 2010: Quantifying Colocalization by Correlation: The Pearson Correlation Coefficient is Superior to the Mander’s Overlap Coefficient. PMID: 20653013

Bolte et al., 2006: A guided tour into subcellular colocalization analysis in light microscopy. PMID: 17210054

Dunn et al., 2011: A practical guide to evaluating colocalization in biological microscopy. PMID: 21209361

Jung et al., 2000: Analysis of Fractalkine Receptor CX3CR1 Function by Targeted Deletion and Green Fluorescent Protein Reporter Gene Insertion. PMID: 10805752

Prasher et al., 1992: Primary structure of the Aequorea victoria green-fluorescent protein. PMID: 1347277

 

艾美捷科技是Synaptic Systems的中國代理商,為科研工作者提供優質的產品與服務。


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