PNA Bio-自定義PNA雜項：更高的親和力、更序列特異性的結合

定制的PNA寡聚物可以未標記或通過染料或其他化學物質標記。它們也可以與肽綴合以添加其他功能?？梢蕴砑舆B接體作為間隔物并且還可以提高溶解度。γ-PNA或修飾的堿基可以進一步增加PNA的Tm和特異性。

艾美捷PNA Bio-定制PNA寡聚物：

PNA/DNA雙鏈通常比相應的DNA/DNA雙鏈具有更高的熔解溫度（Tm）。大致上，每增加一個堿基對，熔解溫度提高約1°C。

由于對互補DNA序列具有高結合親和力，通常不需要設計長的PNA寡核苷酸進行雜交。12-21個堿基的PNA寡核苷酸Z為常見。

強烈建議避免任何自互補序列，如反向重復、形成發夾和回文序列，因為PNA/PNA之間的相互作用比PNA/DNA之間的相互作用更強。

還建議避免富含嘌呤的序列，因為它們由于在水溶液中溶解度低而傾向于聚集。盡量將嘌呤含量限制在60%以下。同時盡量避免超過6個嘌呤的連續序列，特別是連續4個或更多的G堿基。

為了提高PNA探針的溶解性，可以添加溶解性增強劑，如O型連接物、E型連接物、X型連接物或兩個賴氨酸。

PNA Bio-gamma PNA：

伽馬PNA在N-氨基乙基甘氨酸單元的γ-碳原子上有一個立體異構中心。γ-取代PNA可以放置在常規PNA的每一個第三殘基中。

伽馬PNA的熔解溫度（Tm）每單個取代比普通PNA高出5~8℃，這導致具有更高的親和力和更序列特異性的結合。此外，伽馬PNA可以侵入雙鏈DNA形成三螺旋結構。

此外，伽馬PNA還可以提供幾個優勢，如改善的溶解性、更少的自聚集、更穩定的PNA-DNA雙鏈形成，以及為多重標記和其他功能化提供的靈活性。

可能的伽馬功能團：

1、賴氨酸：更好的溶解性，可能用于雙重標記，具有細胞穿透的潛力

2、丙氨酸和谷氨酸也是可能的修飾選項。

由于其高親和力和特異性，PNA寡核苷酸可以高效地與其靶標核酸結合。未標記PNA的一種流行用途是作為PCR反應中特定基因的阻斷劑（PNA夾子）。這項技術可以高效地檢測目標基因中的SNP突變。

PNA可以以任一方向與其靶標核酸結合，但更傾向于反平行而非平行。默認情況下，PNA從5'到3'或從N-到-C書寫，就像DNA或肽一樣。它也從NH2-到-CONH2或從H到-NH2書寫。PNA的5'端NH2-可以與其他功能團共軛，而PNA的3'端-CONH2是一個非活性端。在5'端的乙?；梢宰柚谷魏螡撛诘姆磻浴?/p>

由于PNA的熔解溫度（Tm）高于DNA，通常在大多數應用中使用10~21個堿基的PNA。PNA的長度越長可能會降低溶解性。高嘌呤含量（>60%），特別是G堿基，可能是溶解度低的原因。根據序列，PNA可能的Z長長度約為40個堿基。然而，強烈建議檢查其Tm并設計具有適當長度和序列的探針。

為了提高PNA探針的溶解性，建議為長鏈（>22個堿基）或高嘌呤含量（>60%）的PNA添加溶解性增強劑，如O型連接物、E型連接物、X型連接物或2個賴氨酸。這些連接物也可以作為與其他功能團（如肽或染料）共軛的間隔物。

可能的連接物：

1、O型連接物（也稱為AEEA或eg1）：提高溶解性，Z常用的

2、作為間隔物：O、E、X、C3、C4、C6、C12連接物

3、巰基添加：C6SH、C11SH

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