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EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒,極快速的三步協議

發布者:艾美捷科技    發布時間:2025-06-23     
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EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒是一套完整的優化試劑,專為通過下一代測序技術對各種生物樣本的染色質可及性進行全基因組分析而設計,包括核小體/轉錄因子定位。

 

艾美捷Epigentek-EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒(#P-1071-12)具有以下優勢:

極快速的三步協議:僅需1小時55分鐘即可完成從細胞/組織樣本到測序就緒文庫DNA的整個流程,比ATAC-seq更快。該方法可最大限度減少核損傷,保留染色質結構,并避免線粒體污染。

用途廣泛:適用于新鮮/冷凍組織的小細胞量樣本,即使在惡劣環境下也能使用,與DNAse-seq/MNase-seq相比具有明顯優勢。

減少偏差:由于缺乏序列特異性切割,該方法可最大限度減少片段化偏差以及與GC或AT含量相關的偏差。

全面的試劑盒:包含每個步驟所需的所有必要組分,確保EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒的便捷性和成本效益。

 

原理與流程:

該試劑盒包含從細胞/組織樣本通過NGS進行染色質可及性全基因組分析所需的所有必要試劑。在此實驗中,從細胞/組織中分離出細胞核,并將其暴露于獨特的核酸切割酶混合物中。染色質被片段化,目標染色質兩端的DNA序列被切割/移除,而目標蛋白/組蛋白占據的DNA序列則不受影響。然后將接頭連接到目標蛋白/組蛋白結合的DNA片段上。連接后的DNA被釋放、純化,并使用高保真PCR混合液進行文庫DNA構建。


EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒

左圖. EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒的流程示意圖。

右圖. EpiNext染色質可及性測序DNA文庫的特性分析。

從100,000個MCF-7細胞中分離的染色質被切割并用于EpiNext染色質可及性測序快速試劑盒的DNA文庫制備。該文庫通過Bioanalyzer進行分析。

 

起始材料與輸入量:

起始材料可以包括各種哺乳動物組織或細胞樣本,例如來自燒瓶或微孔板培養的細胞、新鮮和冷凍組織等。最佳反應所需的細胞/組織量可以從50,000個細胞或5 mg組織到500,000個細胞或50 mg組織不等。

 

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