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EpiNext RRBS文庫快速試劑盒,4小時完成,完全轉化

發布者:艾美捷科技    發布時間:2025-06-23     
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EpiNext? RRBS文庫快速試劑盒專為Illumina平臺設計,用于制備簡化代表性亞硫酸氫鹽測序(RRBS)DNA文庫。該試劑盒經過優化的協議和組分,允許使用亞納克級DNA進行MSP1 DNA消化和亞硫酸氫鹽轉化,隨后在不到4小時內完成非條形碼(單重)或條形碼(多重)文庫構建。

 

艾美捷Epigentek-EpiNext RRBS文庫快速試劑盒(#P-1069-24)具有以下優勢:

創新方法:允許快速制備合適大小的富含CpG的DNA片段,并進行亞硫酸氫鹽轉化。亞硫酸氫鹽處理后的DNA可以直接連接到接頭上,從而消除了在其他RRBS方法中常見的接頭連接片段斷裂的可能性。

快速且簡化的流程:從DNA酶消化到可直接使用的文庫DNA,整個過程可在4小時內完成。

完全轉化:將未甲基化的胞嘧啶完全轉化為尿嘧啶(>99%),甲基化胞嘧啶錯誤轉化為胸腺嘧啶的情況極少。

高靈敏度和效率:創新的亞硫酸氫鹽DNA接頭連接方法消除了片段丟失和選擇偏差,使輸入DNA量可低至10 ng,非常適合珍貴且有限樣本的甲基化分析。該試劑盒可用于非條形碼(單重)和條形碼(多重)DNA文庫的制備。

極其便捷:試劑盒包含DNA文庫制備每個步驟所需的所有組分,足夠用于MSP1消化、亞硫酸氫鹽轉化、連接、清潔、大小選擇和文庫擴增,從而實現亞硫酸氫鹽DNA文庫制備的簡化,以獲得最可靠和一致的結果。

最小偏差:超高保真擴增可實現DNA文庫的高產量,并具有最小的序列偏差和低錯誤率。

廣泛的樣本適用性:起始材料可以是來自各種組織/細胞樣本的基因組DNA,如新鮮和冷凍組織、培養細胞(來自燒瓶或微孔板)、顯微切割樣本、福爾馬林固定石蠟包埋組織、活檢樣本、胚胎細胞、血漿/血清樣本和體液樣本等。

 

EpiNext RRBS文庫快速試劑盒原理與流程:

該試劑盒包含從微量輸入DNA生成的亞硫酸氫鹽DNA直接制備文庫所需的所有試劑。在此制備過程中,通過MSP1消化富集合適大小的富含CpG的DNA片段,并進行亞硫酸氫鹽轉化。亞硫酸氫鹽處理后的DNA以單鏈形式存在,隨后同時轉化為雙鏈DNA并連接接頭。接下來,使用MQ結合珠子對連接的片段進行大小選擇和純化,最后使用高保真PCR混合液進行擴增。該流程確保從最少的起始材料中獲得最大產量,并提供具有低錯誤率和最小偏差的文庫DNA的高精度擴增。

EpiNext RRBS文庫快速試劑盒

圖:庫片段的大小分布。使用EpiNext從人Hela DNA制備RRBS DNA文庫RRBS文庫快速試劑盒:輸入DNA:20 ng(紅色痕量),200 ng(藍色痕量)。片段大小為160-800bps,峰值大小為320 bps。

 

起始材料:

起始材料可以是來自各種組織/細胞樣本的基因組DNA,如新鮮和冷凍組織、培養細胞(來自燒瓶或微孔板)、顯微切割樣本、福爾馬林固定石蠟包埋組織、血漿/血清、體液樣本等。DNA不應經過任何先前的限制性酶消化步驟。質粒DNA可用于亞硫酸氫鹽處理,無論是否經過預先線性化,因為該試劑盒允許在整個DNA亞硫酸氫鹽轉化過程中保持DNA的變性狀態,并直接將接頭連接到亞硫酸氫鹽DNA上。DNA輸入量可在10 ng至400 ng之間。為了獲得最佳制備效果,建議輸入量為200 ng。


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