CUT&Tag試劑盒：快速獲得高信噪比的結果

Cleavage Under Target & Tagmentation (CUT&Tag)是一種新興的DNA-蛋白質互作研究方法。CUT&Tag以融合了protein A/G的Tn5轉座酶為核心，融合蛋白通過protein A/G與抗體結合，使得Tn5被栓系在靶位點周圍，從而在目的位點附近進行酶切反應，并同時引入二代測序所必需的接頭序列，產物DNA經過后續提取與PCR擴增后，得到直接用于測序的文庫。CUT&Tag與傳統的ChIP-Seq技術相比較，實驗不需要超聲打斷，也不需要傳統的連接法添加測序接頭，操作簡單、周期短、信噪比高、重復性好、細胞用量少，為極低起始細胞量和單細胞測序研究提供了可能性。

自2019年CUT&Tag技術誕生以來，經過大量的實踐，發現該技術在組蛋白修飾及部分轉錄因子與DNA互作研究中可以獲得高信噪比的結果，但是針對一些與DNA結合力較弱或者結合具有高度動態性的DNA結合蛋白，較難得到理想的實驗結果。

艾美捷CUT&Tag試劑盒特點：

1、高濃縮： 使用獨特的核酸切割酶混合物，其具有低序列偏倚，以同時片段化染色質并切割/去除靶蛋白/DNA復合物兩端的任何DNA序列，而不影響靶蛋白占據的DNA。因此，可以可靠地鑒定真正的靶蛋白富集區域，并且可以實現高分辨率定位。

2、低投入材料： 穩健的無超聲片段化、未結合DNA切割和免疫捕獲均在同一單管中進行，并采用珠上連接。該方法允許在細胞和組織中使用，并允許以Z小的樣品損失對靶蛋白進行Z大的降解保護。結果，輸入細胞量可以少至500個細胞或染色質量可以低至50 ng。

3、原位標記： 在DNA純化之前，DNA銜接子與染色質的珠上連接（原位）導致DNA片段大小增加，允許純化與轉錄因子（TF）結合的非常短的片段（例如：< 70 bp）用于文庫構建。

4、Z低背景： 在靶蛋白/DNA復合物的兩（2）端原位切割未結合的DNA序列能夠使免疫捕獲/測序背景Z小化，從而允許使用<1000萬個讀數進行數據分析。

5、快速、簡化的程序： 從細胞到文庫DNA的過程不到5小時。

6、非常方便：該試劑盒包含CUT&Tag原位測序每個步驟所需的所有組件，足以用于蛋白質/DNA捕獲和捕獲的DNA文庫制備，從而使cTIP（CUT&Tag In-Place）測序試劑盒Z方便，結果可靠且一致。

CUT&Tag試劑盒反應圖示：

DNA-Target Protein-Antibody-ChipTag結合示意圖