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特色產品AAT Bioquest的iFluor?染料經過優化,特別適合標記蛋白質,尤其是抗體。這些染料亮度高、光穩定性好,并且在蛋白質上幾乎不發生猝滅。它們可以被熒光儀器的主要激光線很好地激發(例如,350、405、488、555和633納米)。iFluor? 350染料的熒光激發和發射最大值分別約為345納米和450納米。這些光譜特性使它們成為AMCA和Alexa Fluor? 350標記染料(Alexa Fluor?是Invitrogen的商標)的極佳替代品。iFluor? 350馬來酰亞胺的穩定性合理,并且對巰基具有良好的反應性和選擇性。
艾美捷iFluor 350馬來酰亞胺:
貨號:AAT-1060
單位大?。? 毫克
分子量:355.34
溶劑:DMSO
校正因子(260 納米):0.83
校正因子(280 納米):0.23
消光系數(cm -1 M -1):200001
激發(納米):345
發射(納米):450
量子產率:0.951
H-短語:H303, H313, H333
危險符號:XN
預期用途:僅限研究使用(RUO)
R-短語:R20, R21, R22
儲存:冷凍(< -15 °C);盡量減少光照暴露
庫存溶液的準備:
除非另有說明,所有未使用的庫存溶液應在制備后分成單次使用的小份,并儲存在 -20 °C。避免反復凍融循環。
iFluor? 350 馬來酰亞胺庫存溶液(溶液 B):
向iFluor? 350 馬來酰亞胺的瓶中加入無水DMSO,制成10 mM的庫存溶液。通過移液或渦旋混合均勻。
注意:在開始偶聯之前準備染料庫存溶液(溶液 B)。請立即使用。延長染料庫存溶液的儲存可能會降低染料活性。溶液 B 可以在避光和防潮的情況下在冷凍庫中儲存長達4周。避免凍融循環。
蛋白質庫存溶液(溶液 A):
將100 ?L的反應緩沖液(例如,pH約6.0的100 mM MES緩沖液)與900 ?L的目標蛋白質溶液(例如,抗體,蛋白質濃度盡可能大于2 mg/mL)混合,得到1 mL的蛋白質標記庫存溶液。
注意:蛋白質溶液(溶液 A)的pH值應為6.5 ± 0.5。
注意:不純的抗體或用牛血清白蛋白(BSA)或其他蛋白質穩定的抗體不會被很好地標記。
注意:如果蛋白質濃度低于2 mg/mL,偶聯效率將顯著降低。為了獲得最佳的標記效率,建議最終蛋白質濃度范圍在2-10 mg/mL之間。
可選:如果您的蛋白質不含有游離的半胱氨酸,您必須用DTT或TCEP處理您的蛋白質以生成巰基。DTT或TCEP用于將二硫鍵轉換為兩個游離的巰基。如果使用DTT,您必須在將染料馬來酰亞胺偶聯到您的蛋白質之前,通過透析或凝膠過濾去除游離的DTT。以下是生成游離巰基的示例協議:
用蒸餾水準備新鮮的1 M DTT溶液(15.4 mg/100 ?L)。
在20 mM DTT中制備IgG溶液:每毫升IgG溶液中加入20 ?L的DTT庫存,同時混合。在室溫下靜置30分鐘,無需額外混合(以最小化半胱氨酸重新氧化為胱氨酸)。
將還原的IgG通過預平衡的“交換緩沖液”的過濾柱。收集柱上的0.25 mL分數。
測定蛋白質濃度,并匯集含有大部分IgG的分數。這可以通過分光光度法或比色法完成。
在此步驟后盡快進行偶聯(見樣品實驗協議)。
注意:IgG溶液應大于4 mg/mL以獲得最佳結果。如果抗體濃度低于2 mg/mL,則應濃縮抗體。在緩沖液交換柱上損失額外的10%。
注意:還原可以在幾乎任何pH 7-7.5的緩沖液中進行,例如MES、磷酸鹽或TRIS緩沖液。
注意:步驟3和4可以被透析替代。
樣品實驗協議:
這個標記協議是為山羊抗小鼠IgG與iFluor? 350 馬來酰亞胺的偶聯而開發的。您可能需要針對您的特定蛋白質進行進一步優化。
注意:每種蛋白質都需要不同的染料/蛋白質比例,這也取決于染料的性質。過度標記蛋白質可能會對其結合親和力產生不利影響,而染料/蛋白質比例過低的蛋白質偶聯物則靈敏度降低。
運行偶聯反應:
使用10:1的溶液B(染料)/溶液A(蛋白質)的摩爾比例作為起點:將5 ?L的染料庫存溶液(溶液B,假設染料庫存溶液為10 mM)加入到蛋白質溶液(95 ?L的溶液A)的瓶中,并有效搖動。假設蛋白質濃度為10 mg/mL,蛋白質分子量約為200KD,蛋白質的濃度約為0.05 mM。
注意:我們建議使用10:1的溶液B(染料)/溶液A(蛋白質)的摩爾比例。如果太低或太高,請分別確定5:1、15:1和20:1的最佳染料/蛋白質比例。
繼續在室溫下旋轉或搖動反應混合物30-60分鐘。
純化偶聯物:
以下是一個使用Sephadex G-25柱純化染料-蛋白質偶聯物的示例協議。
根據制造商的說明準備Sephadex G-25柱。
將反應混合物(來自“運行偶聯反應”)加載到Sephadex G-25柱的頂部。
當樣品剛剛低于頂部樹脂表面時,立即添加PBS(pH 7.2-7.4)。
添加更多的PBS(pH 7.2-7.4)以完成所需的樣品柱純化。合并包含所需染料-蛋白質偶聯物的分數。
注意:如果立即使用,染料-蛋白質偶聯物需要用染色緩沖液稀釋,并分裝多次使用。
注意:對于長期儲存,染料-蛋白質偶聯物溶液需要濃縮或冷凍干燥。
表征所需的染料-蛋白質偶聯物:
取代度(DOS)是表征染料標記蛋白質的最重要因素。較低DOS的蛋白質通常具有較弱的熒光強度,但較高DOS的蛋白質也傾向于降低熒光。對于大多數抗體,推薦的最優DOS在2到10之間,具體取決于染料和蛋白質的性質。為了有效標記,應控制取代度,使每摩爾抗體有5-8摩爾的iFluor? 350 馬來酰亞胺。以下步驟用于確定iFluor? 350 馬來酰亞胺標記蛋白質的DOS。
測量吸收:
為了測量染料-蛋白質偶聯物的吸收光譜,建議保持樣品濃度在1-10 ?M范圍內,具體取決于染料的消光系數。
讀取OD(吸光度)在280納米和染料最大吸收(λmax = 345納米,對于iFluor? 350染料)
對于大多數分光光度計,需要將樣品(來自柱分數)用去離子水稀釋,以便OD值在0.1到0.9的范圍內。280納米的O.D.(吸光度)是蛋白質的最大吸收,而345納米是iFluor? 350 馬來酰亞胺的最大吸收。為了獲得準確的DOS,請確保偶聯物中不含未偶聯的染料。

圖:HeLa細胞用小鼠抗微管蛋白染色,然后用iFluor 350山羊抗小鼠IgG(H+L)染色。

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