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特色產品冠狀病毒(CoVs)可引起人類和動物的呼吸道及腸道感染。在新冠病毒(SARS-CoV-2)的復制周期中,3CL蛋白酶(又稱主蛋白酶Mpro)起著至關重要的作用——它負責切割病毒RNA翻譯產生的多聚蛋白前體,將其加工為成熟的非結構蛋白,進而組裝成具有功能的病毒復制-轉錄復合體。由于3CL蛋白酶在病毒復制中的核心地位,其氨基酸序列在不同冠狀病毒中高度保守,且在人體內不存在同源蛋白酶,因此成為抗病毒藥物研發的理想靶點。能夠阻斷病毒復制的蛋白酶抑制劑,是極具潛力的COVID-19治療候選藥物。
為滿足科研人員在3CL蛋白酶抑制劑篩選、酶動力學研究及藥物發現中的需求,艾美捷代理BPS Bioscience公司推出的無標簽3CL蛋白酶檢測試劑盒提供了一套完整、靈敏、高通量兼容的解決方案。該試劑盒采用均相熒光法(homogeneous assay),無需繁瑣的洗滌步驟,以96孔板或384孔板格式提供,包含純化的無標簽3CL重組蛋白酶、熒光底物及優化緩沖液,并內置陽性對照抑制劑GC376。

圖1:3CL蛋白酶測定原理示意圖。
3CL蛋白酶底物是一種內部猝滅的14聚體熒光肽(DABCYL-KTSAVLQSGFRKME-EDANS)。當供體(EDANS)和受體(DABCYL)熒光團緊密靠近時,EDANS發出的能量會被DABCYL(完整的底物)猝滅。在3CL的蛋白酶解作用下,肽底物在谷氨酰胺和絲氨酸殘基之間被切割,生成高熒光肽片段(SGFRKME-EDANS)。熒光強度與3CL的活性成正比。
一、檢測原理:基于FRET的熒光法
本試劑盒的核心檢測技術是熒光共振能量轉移(FRET) 。試劑盒提供的3CL蛋白酶底物是一個14個氨基酸殘基組成的熒光多肽(序列為DABCYL-KTSAVLQSGFRKME-EDANS)。該多肽的兩端分別標記了兩種熒光基團:EDANS(供體) 和DABCYL(受體) 。在完整底物中,EDANS與DABCYL在空間上相互靠近,EDANS受激發后產生的熒光能量被DABCYL吸收并淬滅,因此底物本身不發出熒光。
當加入3CL蛋白酶后,該酶特異性切割底物中谷氨酰胺(Q)與絲氨酸(S)之間的肽鍵,產生含有EDANS標記的熒光肽片段SGFRKME-EDANS。切割后,EDANS與DABCYL分離,淬滅作用消失,EDANS受激發后發出強烈的熒光信號。EDANS的激發峰位于336 nm,發射峰位于455 nm,熒光強度與3CL蛋白酶的活性成正比。
這種“切割即發光”的設計原理,使檢測過程無需分離未切割底物,真正實現了“均相免洗”(add-mix-read) ,極大地簡化了操作流程,尤其適合自動化高通量篩選。
二、試劑盒核心組分與設計優勢
1. 即用型完整組分,操作高效
試劑盒提供所有必需成分:
純化的無標簽重組3CL蛋白酶(BPS Bioscience 100823),保留了天然酶的全部活性,避免了標簽可能帶來的空間位阻干擾。
FRET熒光底物(BPS Bioscience 79952),序列經過優化,具有高靈敏度和高特異性。
3CL蛋白酶檢測緩沖液,優化了pH和鹽離子組成,確保酶反應在最適條件下進行。
陽性對照抑制劑GC376,用于驗證實驗體系的可靠性。
黑色低吸附微孔板及板封膜(部分規格)。
2. 陽性對照GC376:內置的質量控制
試劑盒中包含的GC376是一種已知的冠狀病毒3CL蛋白酶抑制劑,其作用機制是與3CL蛋白酶活性中心的半胱氨酸殘基形成共價鍵,從而不可逆地抑制酶活性。文獻報道中,GC376對SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的IC50可達0.060 μM,被廣泛用作抑制劑篩選實驗的陽性對照。在每次實驗中,使用GC376作為對照,可以驗證酶活性、底物切割效率及檢測體系的有效性,確保篩選數據的可信度。
3. 均相免洗設計,適合高通量篩選
傳統的ELISA方法需要多步洗滌,操作繁瑣且耗時長。本試劑盒采用均相(homogeneous)檢測模式,所有反應在同一孔中進行,無需洗滌步驟,僅需“加樣-混合-孵育-讀數”四個步驟即可完成檢測。這種設計不僅節省了時間,還減少了操作誤差,尤其適合高通量篩選(HTS) 應用——配合自動化移液工作站,可在單次實驗中完成數千個化合物的初篩。
4. 96孔與384孔雙規格,靈活適配不同通量
該試劑盒提供96孔板格式(支持100次酶反應)和384孔板格式(支持400次酶反應)兩種規格,用戶可根據實驗規模靈活選擇。384孔格式的單位反應成本更低,更適合大規?;衔飵旌Y選。
三、應用場景與科研價值
1. 3CL蛋白酶抑制劑的高通量篩選
這是試劑盒的核心應用場景。研究人員可以將待測化合物(小分子藥物、天然產物、多肽等)與3CL蛋白酶預孵育后,加入FRET底物啟動反應。通過檢測熒光信號的變化,定量評估化合物對3CL蛋白酶活性的抑制效果。結合劑量-反應曲線擬合,可快速測定各化合物的IC50值,為后續構效關系研究提供關鍵數據。
2. 酶動力學研究
利用試劑盒中的純化重組酶和底物,研究人員可以測定3CL蛋白酶的關鍵酶動力學參數,包括米氏常數(Km)、最大反應速率(Vmax)和催化效率(kcat/Km)。這些參數有助于深入理解3CL蛋白酶的催化機制,并為抑制劑設計提供結構基礎。
3. 耐藥突變體的活性評估
隨著抗病毒藥物的廣泛使用,新冠病毒已出現多種耐藥突變株(如Nirmatrelvir耐藥突變)。該試劑盒的核心組分——無標簽3CL蛋白酶——可替換為特定突變體的重組酶,用于評估不同突變對酶活性的影響及對現有抑制劑的敏感性變化,為下一代抑制劑開發提供依據。
4. 聯合用藥策略研究
多項研究表明,3CL蛋白酶抑制劑與其他抗病毒藥物(如RNA聚合酶抑制劑瑞德西韋)聯合使用可能產生協同抗病毒效果。利用該試劑盒,可在分子層面評估藥物聯用對3CL蛋白酶活性的抑制效果,為聯合用藥方案的設計提供實驗依據。
四、技術參數與操作要點
規格與儲存
檢測格式:熒光法(均相,無需洗滌)
激發/發射波長:336 nm / 455 nm(EDANS)
物種:SARS-CoV-2
運輸溫度:-80°C(干冰)
穩定性:按照指示儲存,試劑盒在收貨后6個月內保持最佳性能
監管狀態:僅限研究使用(Research Use Only),不可用于臨床診斷
材料要求(試劑盒不提供)
具備激發/發射波長360 nm/460 nm檢測能力的熒光微孔板讀數儀
注意事項
DMSO兼容性:待測化合物通常溶解于DMSO,反應體系中DMSO終濃度不應超過1%。
避免反復凍融:3CL蛋白酶對溫度敏感,建議收到后分裝保存于-80°C,避免多次凍融導致活性下降。
熒光干擾排除:若待測化合物本身具有熒光,需評估其在檢測波長下的自發熒光強度。建議設置化合物單獨對照孔,以排除假陽性/假陰性結果。
陽性對照:每次實驗均應設置GC376陽性對照組,以監控實驗體系的可靠性。
五、文獻參考
1. Jared S. Morse, et al., 2020 Chem.Bio.Chem. 21:730–738.
2. Zhang, L., et al. 2020, Science 368 (6489): 409-412.

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