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品牌專題RNA-蛋白質相互作用在細胞中具有重要作用,包括結構、催化和調節功能。RNA免疫沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)是一種強大的方法,用于研究體內單個蛋白質和RNA分子之間的相互作用。RIP的基本原理與染色質免疫沉淀(ChIP)非常相似,這種方法基于使用針對感興趣蛋白質的特異性抗體來拉下RNA結合蛋白(RBP)和目標RNA復合物。富集蛋白復合RNA后進行qPCR或下一代測序,為研究表觀轉錄組范圍內的蛋白-RNA相互作用提供了一種有利的工具。

傳統的RNA免疫沉淀(RIP)高分辨低,且需要交聯,并且存在重復性差和過程復雜的問題,特別是,耗時較長,且成本較高。為了解決這些問題,EpigenTek開發了一種新的檢測方法,即EpiNext CUT&LUNCH RNA免疫沉淀(RIP)試劑盒,用于研究體內蛋白-RNA相互作用,它整合了目前使用的RIP和CUT&RUN的所有優勢。

貨號 | |
名稱 | EpiNext CUT&LUNCH RNA Immunoprecipitation (RIP) Kit RNA-蛋白免疫共沉淀試劑盒 |
原理 | 試劑盒提供了所有必要的試劑,以富集特定RNA結合蛋白的RNA復合物,從而能夠通過qRT-PCR或NGS分析各種細胞樣本中的蛋白-RNA相互作用。在這個檢測中,細胞被滲透處理,并用針對感興趣蛋白的RIP級抗體處理。然后,一種獨特的核酸切割酶混合物選擇性地切割目標蛋白區域周圍的RNA序列,移除非特異性的RNA-蛋白復合物。只有抗體結合的復合物被選擇性保留。捕獲的蛋白/RNA復合物中的RNA片段被純化,可以直接用于qRT-PCR或cDNA庫構建,以分析蛋白質與RNA之間的相互作用。 |
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結果示例:

使用EpiNext CUT&LUNCH RNA免疫沉淀(RIP)試劑盒進行目標蛋白/RNA富集:從200,000個MCF-7細胞中,使用陽性對照抗體捕獲了SNRNP70/RNA復合物。非免疫IgG用作陰性對照。富集的RNA被純化,并通過Qubit進行熒光定量。
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