Biomatik：RALF1肽（Biomatik定制產品）

文獻標題：Extracellular pectin-RALF phase separation mediates FERONIA global signaling function

DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.11.038

研究背景

植物在生長過程中需要應對各種環境壓力，如高溫、高鹽等。為了適應這些挑戰，植物進化出了復雜的信號傳導機制來調節生長和生存。FERONIA（FER）受體激酶及其配體RALF（快速堿化因子）在植物生長和逆境響應中發揮關鍵作用。RALF肽通過與FER受體相互作用，調控細胞伸長、植物免疫以及生殖過程。然而，FER在多種細胞過程中的廣泛功能是如何實現的，目前尚不清楚。

研究內容

本研究旨在探索FERONIA受體激酶的廣泛信號傳導機制，特別是其配體RALF1如何通過細胞外的相分離過程激活FERONIA依賴的細胞表面響應，從而在植物生長和逆境響應中發揮作用。

研究方法

1. 細胞生物學方法：使用熒光標記的RALF1和FERONIA，觀察其在細胞表面的聚集和內吞作用。

2. 生化分析：通過體外實驗驗證RALF1與果膠的相互作用，并研究其相分離能力。

3. 遺傳學方法：利用擬南芥突變體（如fer-4、llg1-2和ralf1-3）分析FERONIA和RALF1的功能。

4. 環境脅迫實驗：通過高鹽和高溫處理，研究這些逆境條件對RALF1和果膠相分離的影響。

研究結果

1．細胞表面響應：發現RALF1能夠誘導FERONIA和LLG1的聚集和內吞作用，同時還能促進非特異性受體的內吞，這種現象依賴于FERONIA和LLG1。

2．果膠-RALF1相分離：證實了RALF1與果膠能夠發生相分離，并形成分子凝聚體，這些凝聚體能夠招募FERONIA和LLG1。

3．逆境響應機制：高鹽和高溫脅迫能夠觸發果膠-RALF1相分離，進而促進細胞表面受體的聚集和內吞作用，這一過程對于植物從逆境中恢復生長至關重要。

4．功能驗證：通過遺傳學和生化分析，證明了果膠-RALF1-FERONIA-LLG1復合體在植物生長和逆境響應中的功能，揭示了FERONIA信號傳導的細胞外機制。

綜上所述，本研究揭示了FERONIA受體激酶通過其配體RALF1和果膠的相分離過程，廣泛激活細胞表面信號傳導，從而調控植物生長和逆境響應的新機制。

在這篇文獻中，RALF1肽（Biomatik定制產品）的主要應用集中在以下幾個方面：

1. 研究FERONIA受體激酶的信號傳導機制

誘導FER和LLG1的聚集和內吞作用：研究發現，RALF1能夠誘導其受體FERONIA和LLG1的聚集，并促進它們的內吞作用。這種聚集和內吞作用依賴于FER和LLG1的存在，并且是FERONIA信號傳導的關鍵步驟。

觸發非特異性受體的內吞作用：RALF1不僅影響其特異性受體，還能誘導非特異性受體（如BRI1、FLS2等）的聚集和內吞作用，這種現象稱為“promiscuous endocytosis”。

2. 探索細胞外相分離機制

與果膠的相互作用：研究發現，RALF1能夠與細胞壁中的果膠結合，并通過相分離形成分子凝聚體（condensates）。這些凝聚體能夠招募FER和LLG1，形成復合體。

相分離的動態性：通過熒光恢復后光漂白（FRAP）實驗，證實了這些凝聚體是動態的，支持了相分離在細胞外的形成和功能。

3. 研究逆境脅迫下的信號響應

高鹽和高溫脅迫：研究發現，高鹽和高溫脅迫能夠觸發RALF1和果膠的相分離，進而促進細胞表面受體的聚集和內吞作用。這一過程對于植物從逆境中恢復生長至關重要。

逆境響應的分子機制：通過基因表達分析和生化實驗，發現逆境脅迫能夠增加細胞外RALF1和果膠片段的水平，從而增強FERONIA信號傳導。

4. 揭示FERONIA信號傳導的細胞外機制

細胞外信號感知：研究揭示了RALF1和果膠如何通過相分離形成細胞外的信號平臺，從而感知和響應外界信號。

廣泛的細胞表面響應：RALF1誘導的相分離不僅影響FERONIA信號通路，還通過招募其他細胞表面受體和調節因子，廣泛影響植物的生長和逆境響應。

5. 作為研究工具

熒光標記的RALF1：通過化學方法將熒光染料（如Cy3、Alexa647等）標記到RALF1上，用于活體成像和細胞表面受體的共定位分析。

突變體分析：研究中使用了多種RALF1突變體（如I6A、AAA6–8、K43D等），通過分析這些突變體在相分離和信號傳導中的功能，揭示了RALF1的關鍵氨基酸殘基對功能的影響。

總結

RALF1肽在本研究中不僅作為FERONIA受體激酶的配體，用于研究其信號傳導機制，還被用于探索細胞外相分離現象及其在逆境脅迫響應中的作用。這些應用揭示了RALF1在植物生長和逆境適應中的重要功能，并為理解植物細胞外信號傳導提供了新的視角。