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DNA甲基化的研究目前也是熱門的研究之一，大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性及DNA與蛋白質相互作用方式的改變，從而調控基因性狀的表達。 基因表達以及幾乎所有類型的癌癥的發展也與DNA甲基化有關。
那什么是DNA甲基化呢？DNA甲基化是通過DNA甲基轉移酶在胞嘧啶環的第5個碳原子上共價加成甲基而產生的，從而產生5-甲基胞嘧啶（5-mC），在體細胞中，幾乎僅在二核苷酸CpG的對稱甲基化配對中發現了5-mC，而在胚胎干（ES）細胞中，在非CpG中也觀察到了大量的5-mC。5-mC作為表型和基因表達的主要表觀遺傳修飾的生物學重要性已得到廣泛認可。
那么有哪些研究方向和方法以及產品值得推薦的產品來研究DNA甲基化呢？
對甲基化的研究，總的來說大致可以分為三大類：
1、針對DNA甲基化這類的研究最多，其中修飾也是最為穩定的類型；
2、組蛋白的甲基化修飾以及乙?；?/p>
3、RNA甲基化修飾，雖然RNA的修飾有100多種，但主要以A堿基上的6mA甲基化修飾為主，現在關于此的研究也非?；稹?/p>
研究第一步：DNA提取與DNA甲基化定量檢測
Epigentek可提供相關的DNA準備試劑盒，DNA樣品可以從細胞，組織和體液中制備，并且是大多數DNA甲基化應用和測定法中最常用的起始材料。高效，精確和高質量的DNA分離是成功進行基于DNA的實驗的關鍵前提。
| 詳情查看：1、表觀遺傳之DNA甲基化<一> |
研究第二步：研究DNA甲基化的技術手段：一類是IP類的，代表作就是DNA甲基化免疫共沉淀技術（MeDIP-seq），另外一類重亞硫酸鹽處理技術。詳細介紹和產品推薦點擊下方信息：
| 詳情查看：1、表觀遺傳之DNA甲基化<二> |
進階研究：如何檢測單個基因的5mC、5hmC和m6A的量呢？
| 詳情查看：1、如何定量檢測目的基因甲基化水平——m6A? 5mC？5hmC? |
產品推薦
一、DNA樣本提取試劑盒
| FitAmp通用組織切片DNA分離試劑盒Cat #P-1003 | FitAmp血漿/血清DNA分離試劑盒 cat#p-1004 | FitAmp尿液DNA分離試劑盒 cat#p-1017 | FitAmp血液和培養細胞DNA提取試劑盒 cat#p-1018 | FitAmp凝膠DNA分離試劑盒 cat#p-1007 | FitAmp石蠟組織切片DNA分離試劑盒 cat#p-1009 | |
| 形式 | spin column | spin column | spin column | spin column | spin column | spin column |
| 結合能力 | 5 ?g | 5 ?g | 5 ?g | 5 ?g | 5 ?g | 5 ?g |
| 回收率 | >70% | >70% | >70% | >70% | >70% | >70% |
| 起始材料 | 組織切片 | 血漿，血清或體液 | 尿液 | 血液白細胞或培養的哺乳動物細胞 | 低熔點瓊脂糖凝膠 | 福爾馬林固定，石蠟包埋的組織 |
| 輸入量 | 低至1 ng | 低至1 ng | 1 ng to 2 ?g | 1 ng to 4 ?g | 1 ng to 1 ?g | 1 ng to 2 ?g |
| 時間 | 2h | 12min | 20min | 20min | <15min | 2h |
二、DNA甲基化定量檢測試劑
| MethylFlash甲基化DNA定量試劑盒（比色） Cat #P-1034 | MethylFlash Global DNA甲基化（5-mC）ELISA簡易試劑盒（比色） Cat #P-1030 | MethylFlash Global DNA羥甲基化（5-hmC）ELISA簡易試劑盒（比色） Cat #P-1032 | MethylFlash 5-甲酰基胞嘧啶（5-fC）DNA定量試劑盒（比色） Cat #P-1041 | |
| 目的 | 比色法檢測DNA中的5mC | 比色法檢測DNA中的5mC | 比色法檢測DNA中的5hmC | 比色法檢測DNA中的5fC |
| 關鍵點 | 在主要期刊中被高度引用的方法 與HPLC-MS可比的結果 | 減少交叉變化并提高準確性 快速便捷的“一步式”測定反應 | 強大的第四代MethylFlash技術應用于5hmC研究 | 強大的MethylFlash技術應用于5fC研究 |
| 起始材料 | DNA | DNA | DNA | DNA |
| 輸入范圍 | 50-200 ng | 20-200 ng | 50-200 ng | 100-300 ng |
| 最佳輸入量 | 100 ng | 100 ng | 100 ng | 300 ng |
| 總時長 | 4 hours | 2 hours | 2 hours | 4 hours |
| 檢測閾值 | 200 pg of meDNA | 50 pg of meDNA | 10 pg of hMeDNA | 1 pg of fC DNA |
| 檢測到的甲基化類型 | 5-甲基胞嘧啶 | 5-甲基胞嘧啶 | 5-羥甲基胞嘧啶 | 5-甲?；奏?/td> |
| 特異性 | >1000:1 meDNA:unMeDNA | >1000:1 meDNA:unMeDNA | >1000:1 hMeDNA:unMeDNA | >1000:1 fC DNA:unMeDNA |
| 形式 | ELISA-like Microplate-based | ELISA-like Microplate-based | ELISA-like Microplate-based | ELISA-like Microplate-based |
三、DNA甲基化修飾相關產品：利用DNA甲基化修飾研究手段——DNA亞硫酸鹽轉化技術產品推薦：
| Methylamp DNA Modification Kit Cat #P-1001 | BisulFlash DNA Modification Kit Cat #P-1026 | Methylamp Whole Cell Bisulfite Modification Kit Cat #P-1016 | |
| 代碼名稱 | “經典” | “快速” | “直接” |
| 目的 | 基于化學的DNA亞硫酸氫鹽轉化 | 基于快速熱基的DNA亞硫酸氫鹽轉化 | 直接從細胞，組織，唾液，尿液或血液中轉化 |
| 關鍵點 | 1. 兼容Illumina工作流程 2. 最堅固可靠 3. 亞硫酸氫鹽測序，NGS和各種MSP的理想選擇 | 1. 極快 2. 實時MSP的理想選擇 3. 可選的測序方案 | 1. 消除了分離DNA的步驟 2. 非常適合包含少量DNA的樣品 |
| 起始原料 | DNA | DNA | 細胞，組織，血液 |
| 最低輸入量 | 50 pg | 200 pg | 100 細胞, 1 ?l 血液 |
| 操作總時長 | < 2 h | 30 min | < 3 h |
| 洗脫體積 | 8-20 ?l | 10-20 ?l | 8-20 ?l |
| 轉換效率 | 99.9% | 99.9% | 99.9% |
| 脫硫/凈化 | √ | √ | √ |
| 回收率 | >75% | >75% | >85% |
| 轉換后DNA片段大小 | 200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp | 100-400 bp; Avg. Peak of 250 bp | 200-2000 bp; Avg. Peak of 800 bp |
| 形式 | 旋轉柱 | 旋轉柱 | 旋轉柱 |
四、甲基化DNA免疫沉淀（meDIP）是一種基于抗體的大規模技術
| Methylamp甲基化DNA捕獲（MeDIP）試劑盒 Cat #P-1015 | EpiQuik羥甲基化DNA免疫沉淀（hMeDIP）試劑盒 Cat #P-1038 | EpiQuik MeDIP Ultra KitCat #P-1052 | EpiQuik甲基化DNA免疫沉淀試劑盒 cat＃P-2019 | EpiQuik組織甲基化DNA免疫沉淀試劑盒 cat＃P-2020 | |
| 目的 | 富集并捕獲甲基化的DNA片段 | 富集并捕獲羥甲基化的DNA片段 | 從低起始輸入中富集并捕獲甲基化的DNA片段 | 直接從細胞裂解物中富集并捕獲甲基化的DNA片段 | 直接從組織中富集并捕獲甲基化的DNA片段 |
| 關鍵點 | 1. PCR和微陣列的理想選擇 2.兼容Illumina工作流程 | 1. 與下游工作流程兼容，包括hMeDIP-PCR和hMeDIP-chip | 1. MeDIP-Seq的理想選擇 2.兼容Illumina 3. 工作流程 最敏感和最具體 | 1. 通過直接從細胞中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分離步驟 | 1. 通過直接從組織中免疫沉淀meDNA片段2. 消除了DNA分離步驟 |
| 起始原料 | DNA | DNA | DNA | 細胞 | 組織 |
| 最低輸入量 | 0.2-1 ?g | 0.1 ?g | 50 ng DNA (10,000 cells) | 100,000 cells | 10mg |
| 操作總時長 | < 3 hours | < 3 hours | < 3 hours | < 4 hours | <3.5h |
| 富集效率 | > 98% | > 99% | > 99% | > 95% | > 95% |
| 轉換效率 | 99.9% | 99.9% | 99.9% | 99.9% | 99.9% |
| 包含高度特異性的抗體 | √ | √ | √ | √ | √ |
| 包括DNA純化柱 | √ | √ | √ | √ | |
| 容器形式 | 96孔板 | 96孔板 | 96孔板 | 96孔板 | 96孔板 |
五、檢測A基因的DNA 5mC甲基化水平產品：MSP/IP
| 產品A | 產品B |
| Cat#p-1026 BisulFlash DNA Modification Kit | Cat#p-1028 Methylamp MS-qPCR Fast Kit |
| 搭配描述：客戶可用自己的方式提取DNA，再用p-1026進行亞硫酸鹽轉換，轉換后甲基化的5-mC保持不變，沒有甲基化C轉換成U。之后用p-1028進行MS-qPCR，針對目的基因設計一對靶向甲基化區域的引物進行PCR即可。而且用我們的MS-qPCR可將時間縮短到70min（1h 10min）鐘喲，普通的一般需要（2.5h） | |
| Cat# p-1015：Methylamp Methylated DNA Capture (MeDIP) Kit Cat# p-1052：EpiQuik MeDIP Ultra Kit | Cat# p-1028：Methylamp MS-qPCR Fast Kit Cat# p-1029: EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit |
| 搭配描述：客戶可用自己的方式提取DNA，再用p-1015或者p-1052進行5mC甲基化DNA下拉富集，再用p-1028進行甲基化特異性PCR實驗，進行特異基因甲基化的定量。也可以使用p-1029進行qPCR。（廠家推薦：p-1052&p-1029；） | |
六、定量檢測A基因的 5hmC甲基化水平
| 產品A | 產品B |
| Cat# p-1038：EpiQuik? Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation (hMeDIP) Kit | Cat# p-1029: EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit |
| 搭配描述：客戶可用自己的方式提取DNA，再用p-1038進行5hmC甲基化DNA下拉富集，再用p-1029，進行特異基因5hmC甲基化的定量。 | |
七、定量檢測A基因的 RNA m6A甲基化水平
| 產品A | 產品B |
| Cat# p-9018：EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit Cat# 202-003：m6A 抗體 | Cat# p-1029: EpiQuik? Quantitative PCR Fast Kit |
| 搭配描述：客戶可用自己的方式提取RNA，用p-9018進行m6A RNA富集，將富集后的m6A RNA進行發轉錄后，進行qPCR。也可以使用我們的m6A抗體，進行IP實驗，我們的m6A抗體適用實驗類型多，物種廣，參考文獻多，感興趣的歡迎前來垂詢~~（目前p-9018和202-003都是現貨~~） | |
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