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對染色質研究產品有疑問嗎?植物ChIP試劑盒來解答!

發布者:艾美捷科技    發布時間:2020-11-13     
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       一年一度雙十一再次來臨,想必很多小伙伴已經早早在購物車收藏了很多心儀的寶貝,想想之前明明是光棍節,現在卻演變成了購物節。大家在購物的時候,是不是貨比三家,從產品的性能,外觀,質量,價格等方面進行綜合考慮,最后再敲定下來買什么(當然,有錢人是不用考慮價格的)。

 

      而最近有很多人問詢了染色質研究相關的問題,實驗室老手們目標清晰的,基本就是確認一下產品是否能夠滿足他們的需求,確認滿足后就可以加載到購物車然后下單購買;但是新手們拿到課題后就眼前一抹黑,大腦一團糊,我該做什么?我要買什么呢?可能會從很多文獻找別人用過覺得好的,自己琢磨可能行的,師兄師姐推薦的等等,最后導致選擇困難癥。小編今天就給大家推薦一下染色質研究方面的產品。

 

      萬變不離其宗,要做一個實驗或者開始自己的課題之前,首先需要了解相關的基礎知識。

 

      首先我們來說說染色質的概念以及研究方向。

 

      染色質:是指間期細胞核內由DNA、組蛋白、非組蛋白及少量RNA 組成的線性復合結構,是間期細胞遺傳物質存在的形式,基本單位是核小體。

 

      核小體:由約 146 bp DNA 纏繞組蛋白八聚體組成。組 蛋 白 H2A/H2B/H3/H4 屬于核心組蛋白,能夠被各種修飾酶共價修飾。

 

核小體

圖源:百度

 

      重要性:染色體以染色質基本結構單位核小體為基本單位,通過核小體的結構及其與DNA相對序列位置發生改變,達到生命過程中的基因組包裝和基因組可利用性間的平衡。

 

      通常,染色質的凝聚程度越高,轉錄因子和其他DNA結合蛋白就越難以訪問DNA并完成其任務。相反,DNA越容易接近,周圍基因被主動轉錄的可能性就越大。核小體的存在(或不存在)直接或間接影響各種細胞和代謝過程,例如重組,復制,著絲粒形成和DNA修復等。

 

      由此可見,染色質的研究是非常重要的。那么如何開始呢?每個老師可能都有自己的想法,有確定的研究方向,今天我給大家說說比較普通的2條研究途徑,如下圖所示:

染色質研究

      您是不是想問,我該怎么選擇產品呢?接下來我們以問答的形式為大家講解:

 

       一:染色質可及性研究線路

 

        1.我要進行染色質可及性分析,我的植物嫩葉組織該怎么處理呢?

 

       RE:為了闡明染色質和轉錄因子之間相互作用的關系,至關重要的是通過繪制沿基因組的核小體定位圖來確定染色質的可及性。

 

       針對此,我們有相關的產品推薦: P-1047 EpiQuik Chromatin Accessibility Assay Kit ,而適用于這個產品需要輸入的樣本是:細胞提取物,染色質,單個樣品。

 

       樣本是植物嫩葉,我們有專門針對植物的染色質提取試劑盒:P-2022,ChromaFlash™ Plant Chromatin Extraction Kit,可簡單、快速的從植物中分離出染色質或DNA-蛋白質復合物,用于下游分析實驗。

 

        2.那你們的這個植物染色質提取試劑盒原理是什么?有什么優勢呢?

 

      RE: 原理:使用提供的裂解緩沖液可分解帶有或不帶有交聯的樣品細胞膜,然后用提取緩沖液提取染色質或DNA-蛋白質復合物。

 

      優勢:

     【1】極其快速的過程:從植物樣品到即用染色質的整個過程不到2小時。

     【2】方便靈活:該試劑盒適合從單層或懸浮細胞或組織中制備天然染色質和交聯染色質。

     【3】無需染色的染色質:使其可定制用于需要完整或片段染色質的各種分析工作流程,包括ChIP,體外蛋白質-DNA相互作用分析,核酶測定等。

 

      同樣我們還有其他染色質提取試劑盒:

 

貨號產品名稱應用描述
P-2001-100次ChromaFlash Chromatin
Extraction Kit
Chip實驗(搭配P-2025和P-2026),體外蛋白質-DNA結合測定和核酶測定從哺乳動物細胞或組織中分離出染色質或DNA-蛋白質復合物,簡單、快速。
P-2023-100次ChromaFlash Chromatin
Isolation & Shearing Kit
Chip 實驗,體外蛋白質-DNA結合測定從哺乳動物細胞或組織中分離和剪切染色質

 

       3.染色質可及性研究試劑盒原理是什么呢?

 

      RE:  P-1047  EpiQuik Chromatin Accessibility Assay Kit

 

      原理: 在該測定中,從細胞/組織中分離出染色質,并用核酸酶混合物處理。然后分離DNA,并通過實時PCR擴增,以進行染色質可及性的區域特異性分析。

 

       二:染色質免疫免疫共沉淀研究路線

 

       1.首先,要進行免疫共沉淀實驗肯定必不可少的就是染色質的提取啦,這些產品同上哦。

 

      不過我們的一些ChIP試劑盒可以集染色質提取和ChIP兩個實驗于一體,無需額外購買染色質提取試劑盒,比如我們賣的超火的產品:植物ChIP 試劑盒P-2014和哺乳動物細胞ChIP試劑盒p-2002。下面是我們的客戶針對植物ChIP試劑盒P-2014的一些咨詢,希望這些能幫到您。

 

       2.染色質免疫共沉淀相關產品

 

       2.1 “我的樣本是水稻原生質體,可以用P-2014 植物ChIP試劑盒嗎?這個試劑盒的陽性對照可適用嗎?”

 

      RE:是的,原則上對于水稻樣品,At4g03770或At4g03800的引物可用于PCR陽性對照。

 

     PS:該試劑盒針對植物開發,產品名稱說的是植物,所以大部分植物都是適用的。(但是不能保證任何植物)

      已經發布文章驗證的物種有:擬南芥,番茄,羊草,煙草,蘋果,豆類,玉米等。

 

       2.2 “我的樣本是通過短暫轉化成這些分離的水稻原生質體的外源蛋白質,然后用這些成功表達目標蛋白質的水稻原生質體進行ChIP。 那么,使用該試劑盒需要多少分離的水稻原生質體?”

 

      RE:通常,每個反應中5 * 10 ^ 5至2 * 10 ^ 6細胞(例如分離的水稻原生質體)應該是足夠的輸入材料。

 

       2.3CP3C,D,E,F的所有組件都是裂解緩沖液,它們之間有什么區別? 對于分離的水稻原生質體,是否都需要使用? 如果不添加CP3C,然后在組織裂解和DNA剪切部分的步驟2之后直接添加CP3D,可以嗎?”

 

      RE:CP3C會破壞細胞壁。 CP3F會破壞核膜。 CP3D和CP3E包含不同的蔗糖濃度,并用于通過蔗糖梯度濃縮細胞核。
      如前所述,對于已經從細胞壁剝離的分離的水稻原生質體起始材料,可以跳過P-2014協議的``組織裂解和DNA剪切''部分下的步驟3-4(這些步驟是用于細胞壁破碎的 )。 因此,這些樣品不需要CP3C。

 

      2.4 “您能否在組織裂解和DNA剪切部分幫助解釋步驟7的原理?”
      RE:將第6步中重懸的沉淀物在第7步中的300 µl CP3E緩沖墊上分層,包括蔗糖梯度離心,可以分離出更多的染色質。

 

       2.5 “在組織裂解和DNA剪切部分的步驟8中,僅在此步驟中添加了蛋白酶抑制劑混合物(PIC),為什么在前面的步驟中不使用該PIC? 是否需要在上述步驟中添加它以防止蛋白質降解?”

 

      RE:PIC僅在第8步添加,因為實際上是從核中提取了染色質。 在此步驟中添加PIC最重要,以便直接在免疫沉淀步驟之前保留蛋白質與DNA的相互作用。

 

       2.6 “我還想用水稻葉子進行實驗(疏水的),在進行交聯步驟時,這可能導致甲醛無法滲透。在這種情況下,可以添加一些表面活性劑嗎?

 

      RE:關于其疏水性水稻葉樣品在P-2014分析的交聯步驟中甲醛滲透效率的詢問,在調整交聯時間長度的情況下,任何樣品中的甲醛滲透都很好。 但是,如果客戶認為有用,則可以添加表面活性劑滲透步驟。

 

       2.7 “我想用其他染色質提取的試劑盒提取染色質,然后再用這個試劑盒進行ChIP可以嗎?具體的操作是什么呢?

 

      RE:是可以的,已通過其他方法提取并交聯的未片段化染色質可用于此ChIP試劑盒,從方案的步驟8(第6頁)開始,方法是將染色質沉淀物重新懸浮在CP3F緩沖液中并剪切DNA。

 

      以上是我們的植物ChIP劑盒的一些客戶問詢與解答,我們還有其他的chip試劑盒供大家選擇哦:

 

      【1】 普通染色質ChIP

 

貨號產品名稱輸入
材料
下游應用產品描述
P-2027ChromaFlash High Sensitivity ChIP Kit細胞,組織 ChIP-PCR,ChIP-on-chip,ChIP-seq來自少量細胞或組織的選擇性免疫沉淀和染色質組分的富集
P-2002EpiQuik ChIP Kit哺乳動物細胞qPCR, ChIP-Seq, and ChIP-on-chip專為細胞輸入而設計,選擇性免疫沉淀和細胞染色質富集
P-2003EpiQuik Tissue ChIP Kit哺乳動物組織qPCR, ChIP-Seq, and ChIP-on-chip.專為組織輸入而設計,選擇性免疫沉淀和組織中染色質組分的富集
P-2026ChromaFlash One-Step Magnetic
ChIP Kit
各種物種,哺乳動物最合適,分離的染色質基于磁珠的ChIP可實現自動化一步法使用磁珠對沉淀的染色質進行免疫沉淀和剪切
P-2028EpiNext™CUT&
RUN Fast Kit
各種哺乳動物細胞單重或者多重文庫建立最小的非特異性背景水平下捕獲目標蛋白質/ DNA復合物,較少的偏倚和高分辨率定位目標蛋白質-DNA相互作用區域。

 

      【2】體外蛋白質-DNA互作

 

 

貨號產品名稱描述
P-2004-96EpiQuik General Protein-DNA Binding Assay Kit (比色法)適用于體外分析蛋白質-DNA相互作用,特別適用于使用哺乳動物組織和細胞提取物檢測轉錄因子激活
P-2005-96EpiQuik General Protein-DNA Binding Assay Kit (熒光法)適用于體外分析蛋白質-DNA相互作用,特別適用于使用哺乳動物組織和細胞提取物檢測轉錄因子激活

 

      【3】組蛋白甲基化/乙?;?甲基-DNA結合蛋白ChIP

 

 

貨號產品名稱
P-2006EpiQuik Methyl-Histone H3K9 ChIP Kit
P-2016EpiQuik Tissue Methyl-Histone H3K27 ChIP Kit
P-2010EpiQuik Acetyl-Histone H3 ChIP Kit
P-2011EpiQuik Acetyl-Histone H4 ChIP Kit
P-2017EpiQuik Methyl-CpG Binding Domain Protein 2 ChIP Kit

 

      3.做完ChIP之后,有的客戶可能需要做PCR分析和NGS文庫制備等實驗,我們也有針對這類實驗的相關產品

 

貨號產品應用描述
P-1063EpiNext DNA Purification
HT System
文庫構建利用磁珠技術進行高通量DNA或PCR擴增子的純化以及DNA大小的選擇,還可用于濃縮DNA
P-1053EpiNext High-Sensitivity DNA Library
Preparation Kit (Illumina)
文庫構建適合使用亞納米級的DNA輸入量制備DNA文庫,用于使用Illumina測序儀的下一代測序應用,基因組DNA序列,ChIP序列,MeDIP / hMeDIP序列等
P-1051EpiNext DNA Library
Preparation Kit (Illumina)
文庫構建適合使用Illumina測序儀制備用于下一代測序應用的DNA文庫,其中包括基因組DNA序列,ChIP序列,MeDIP / hMeDIP-seq,亞硫酸氫鹽序列和靶向重測序等。

 

      我們的產品種類很豐富,基本可以滿足您的大部分需求,不知道有沒有您需要的呢?預知跟多詳情,請咨詢小艾喲~~

 

 

      作為一家具有高端的技術實力、先進的經營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業,總部位于武漢光谷高新技術開發區,服務面向全國。艾美捷科技是集進口試劑、實驗室耗材銷售、技術服務與合約開發為一體的專業化高科技公司,為用戶提供專業的前沿資訊、完備的產品、整合的解決方案,及優質的物流服務。為了更好的服務客戶,公司組建了一支經驗豐富的研發團隊-艾美捷生物技術中心,進入研發生產階段,將更優質的產品推薦給國內生物領域的同仁們!

 

      艾美捷科技與國內外優秀的生物試劑供應商優保持著密切的合作關系,目前已成為眾多國際知名品牌的中國總代理或一級代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abnova、Agrisera、Biovision、Biosensis、Cayman Chemical、Caisson Labs、Cytoskeleton、CytoNiChe、Epigentek、Equitech-Bio、Hycult Biotech、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、ProSpec、Norgen Biotek、Mabtech、Matreya、iRegene、StressMarq、ImmunoReagents、SouthernBiotech、Origene、US Biological、Solis BioDyne等,可以在短時間內為用戶提供專業的前沿資訊、完備的產品及物流服務。

  

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