Epigentek 染色質研究和ChIP工作流程方案

什么是染色質免疫沉淀 （ChIP）？

研究染色質相關修飾廣泛使用的方法之一是染色質免疫沉淀（ChIP），這是目標蛋白質與特定基因組DNA區域結合的過程。這種流行的 ChIP 檢測方法為表觀遺傳學研究人員提供了有關某些蛋白質或蛋白質修飾與特定 DNA 序列之間相互作用的寶貴信息。

蛋白質-DNA相互作用對某些細胞功能至關重要，例如DNA復制和重組，基因轉錄，染色體分離，信號轉導和表觀遺傳沉默。例如，了解蛋白質-DNA相互作用可用于比較兩個不同組（例如患病或健康的組織）中與特定基因啟動子區域相關的組蛋白甲基化量。染色質免疫沉淀方法也可用于繪制各種其他組蛋白修飾的基因組位置。

ChIP 是否適合您的實驗？

由于染色質免疫沉淀和各種下游應用可能需要時間并帶來相關費用，因此值得了解 ChIP 是否適合您的研究。

首先，建議查看與您提議的實驗相關的現有文獻。有時，其他研究人員已經完成了跑腿工作，為您的研究奠定了堅實的基礎，而無需重新發明輪子。從這里開始，您的團隊可以采取變化和獨特的角度，使研究變得有趣、獨特和有價值，同時回顧以前完成的工作，以發現以前的研究人員面臨的任何潛在障礙或問題。讓別人的經驗對你有利，提前從你自己的學習中節省時間和頭痛。

最后，研究人員可能已經對您的靶標進行了 ChIP，因此可以節省大量寶貴的時間和精力?？梢哉业酱祟愋畔⒌囊恍┏Ｒ娰Y源包括USCS基因組瀏覽器，ENCODE項目和NCBI。在進行研究之前，請務必查看這些資源以獲取信息，以查看工作是否已經完成。如果還沒有，并且您的目標尚未闡明，則進行 ChIP 實驗可能是您研究的正確解決方案。

艾美捷代理Epigentek 染色質研究步驟詳細信息：

染色質分離

染色質是DNA和蛋白質的組合，將DNA包裝成更小的體積以適應細胞，有助于防止DNA損傷，并控制基因表達和DNA復制。染色質樣品的適當分離是研究蛋白質-DNA相互作用的重要因素。EpiGentek專有的染色質分離試劑盒使用多種方法確保完整染色質的質量分離，以幫助從哺乳動物或植物細胞和組織中提取染色質。

目錄#      名字      描述

P-2001   閃光染色質提取試劑盒   用于從哺乳動物細胞或組織中分離完整的染色質

P-2022   閃色植物染色質提取試劑盒   用于從植物細胞或組織中分離完整的染色質

P-2023   ChromaFlash 染色質分離和剪切套件   用于以簡單快速的形式從哺乳動物細胞或組織中分離染色質或 DNA-蛋白質復合物，然后通過超聲處理進行剪切步驟

染色質可及性

染色質結構是基因調控的重要決定因素，所涉及的主要因素之一是染色質對轉錄因子和其他DNA結合蛋白的可及性。一般來說，染色質越濃縮，轉錄因子和其他DNA結合蛋白就越難進入DNA并執行其任務。DNA越容易獲得，周圍基因被積極轉錄的可能性就越大。研究染色質結構的可及性對于提供核小體存在與否的信息特別感興趣，核小體直接或間接影響一系列其他細胞和代謝過程。

目錄#      名字      描述

P-1047   EpiQuik 染色質可及性檢測試劑盒   用于染色質定量分析和真染色質或異染色質狀態的測定

染色質碎裂

染色質樣品的超聲能量處理是酶消化方法的一種被廣泛接受的替代方案。通過強調超聲技術中的更高通量處理和防止樣品污染，我們的EpiSonic?超聲儀可以輕松集成到現有的實驗室工作流程中，并且特別適合與表觀遺傳學和下一代應用的兼容性。

目錄#      名字      描述

EQC-2000   EpiSonic 2000 超聲系統   用于下一代測序應用中 DNA 和染色質的多樣品剪切

染色質免疫沉淀 （ChIP）

由于蛋白質-DNA相互作用在細胞功能中起著至關重要的作用，因此識別DNA結合蛋白的遺傳靶標并了解蛋白質-DNA相互作用的機制對于理解細胞過程至關重要。研究人員研究這些相互作用的工具之一是染色質免疫沉淀或ChIP。與其他方法相比，ChIP 的優勢在于該過程允許檢測與活細胞中基因特定序列的特定蛋白質結合。EpiGentek 提供一系列檢測試劑盒解決方案，幫助您的實驗室高效、準確、重復地成功進行基于 ChIP 的實驗。

目錄#      名字      描述

P-2002   EpiQuik 染色質免疫沉淀 （ChIP） 試劑盒   用于通過微孔板形式從細胞輸入樣品中特異性免疫沉淀染色質

P-2027   色閃光高靈敏度 ChIP 套件   用于從少量哺乳動物細胞或組織中免疫沉淀染色質 （ChIP）

P-2014   EpiQuik Plant ChIP 套件   用于從植物輸入樣品中特異性免疫沉淀染色質

PCR/測序 （ChIP-Seq） NGS 分析

NGS（下一代測序）技術更進一步，增加了數據輸出量并降低了 ChIP 測序的成本。ChIP-Seq 提供了已經討論過的染色質免疫沉淀過程與下一代測序方法的組合，為鑒定轉錄因子和其他蛋白質的全基因組 DNA 結合位點提供了一種有效的方法。ChIP-Seq 提供了在全基因組水平上解析靶蛋白結合位點的特定基因序列的優勢。實時定量PCR（RT-qPCR）提供了一種替代方法，通過使用特異性引物的選擇性擴增，在精確的位點分析修飾組蛋白和/或其他DNA結合蛋白的結合位點。EpiGentek為PCR和NGS提供各種廉價的解決方案，包括完整的包裝試劑盒，可以方便地從少量或困難的樣品中構建高質量的DNA文庫。

目錄#      名字      描述

P-2030   EpiNext ChIP-Seq 高靈敏度套件 （Illumina）   用于從低起始量細胞進行簡化的 ChIP 測序 NGS 文庫制備

P-1029   EpiQuik 定量 PCR 快速試劑盒   用于 ChIP 的定量實時聚合酶鏈反應 （PCR） 分析

剪切和運行 / 切割和標簽

近年來，已經取得了一些進展，這些發展正在徹底改變研究人員通過稱為CUT&RUN的過程進行DNA-蛋白質相互作用分析的方式。代表靶標下的切割和使用Nuclease，開發用于從有限的生物材料中釋放捕獲的目標蛋白/ DNA復合物，以繪制蛋白質 - DNA相互作用，并顯著提高定位分辨率。這個過程允許使用更少的輸入材料，同時限制背景信號。作為擴展，cTIP（CUT & Tag In Place）增加了為下一代測序準備文庫的步驟，并為ChIP-Seq提供了類似的解決方案，具有前面提到的所有好處。隨著研究格局的變化，CUT&RUN和cTIP有望成為越來越流行的DNA-蛋白質相互作用研究方法，因為它們具有廣泛的益處。

目錄#      名字      描述

P-2028   EpiNext CUT & RUN 快速套件   為了用來自低起始細胞/染色質的蛋白質富集特定的 DNA 復合物，通過 NGS 鑒定或繪制體內蛋白質-DNA 相互作用

P-2032   EpiNext cTIP （CUT&Tag In-Place）-測序試劑盒   用于從低起始細胞/染色質富集蛋白質特異性 DNA 復合物，并使用 Illumina 平臺制備 NGS 文庫

艾美捷科技是Epigentek的中國代理商，為科研工作者提供優質的產品與服務。