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Epigentek:EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit

發布者:艾美捷科技    發布時間:2025-06-19     
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m6A RIP.png 


隨著超萬篇m6A研究論文的發表(2025年NCBI數據), N6-甲基腺苷(m6A) 已成為RNA表觀遺傳調控的核心靶點。傳統MeRIP技術因分辨率低(100-200 nt)、樣本需求大(μg級)、操作繁瑣等缺陷,難以滿足精準醫學需求。EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit(貨號P-9018-24) 通過原位酶切富集技術,實現單堿基分辨率的m6A檢測,在腫瘤、免疫、神經科學等8大領域獲得權威驗證,助力25+頂級期刊研究成果產出。

 

一、技術革命:CUT&RUN如何重塑m6A研究范式?

1. 核心原理突破

·原位抗體錨定:抗m6A抗體直接結合完整RNA的修飾位點,保留天然構象(避免傳統片段化導致的表位丟失)

·酶控空間切割:核酸酶僅在抗體結合位點±50 bp范圍內切割,分辨率達單堿基級別(較MeRIP提升200倍)

·磁珠定向回收:專利RNA結合磁柱實現一步洗脫,回收率>95%(傳統方法<60%)


操作流程對比(以肝癌樣本為例)

步驟

傳統MeRIP (Zhou et al. 2022)

CUT&RUN (本試劑盒)

樣本處理

超聲片段化(30 min)

免片段化

抗體孵育

過夜(16 hr)

90 min

富集純度

非特異性結合率>40%

<5%

最低RNA輸入量

5 ug

200 ng

 

2. 全流程兼容性升級

·下游分析拓展:兼容qPCR(如SOX9 m6A驗證)、RNA-seq(HIV感染模型)、dPCR(果蠅神經毒性研究)

·復雜樣本適配:成功應用于微量細胞(200 ng iSCs)、組織裂解液(骨溶解模型)、病毒RNA(HIV-1感染)

 

二、權威案例:多領域研究成果全景圖

1. 腫瘤機制與靶向治療

·肝癌代謝重編程:Zhou等利用本試劑盒發現YTHDF3-PFKL糖酵解軸,m6A修飾使PFKL mRNA穩定性提升3倍,驅動肝癌進展(Hepatology 2022)。

·關鍵數據:Sk-Hep-1細胞中,YTHDF3敲除后PFKL m6A富集下降72%(qPCR驗證)

 

·前列腺癌靶點篩選:Chen等在沙嶺豬睪丸發育模型中發現SOX9基因m6A修飾通過ALKBH5調控,富集效率較MeRIP提升2.3倍(Genomics 2023)

 

2. 免疫調控與炎癥疾病

·巨噬細胞機械感應:Hu等證實基體剛度通過Socs1 m6A修飾調控炎癥:高剛度環境下,YTHDF2介導的Socs1 m6A修飾升高5.8倍,促進TNF-α釋放(ACS Nano 2022)

※技術亮點:僅用500 ng巨噬細胞RNA完成4組力學條件平行篩選

·自身免疫病新機制:Zhou等揭示YTHDC1通過穩定Beclin1 mRNA抑制自噬,m6A缺失導致狼瘡模型炎癥因子暴發(Cell Reports 2024)

 

3. 神經退行性疾病

·tau蛋白神經毒性:Atrian等發現m6A驅動環狀RNA形成,促進tau聚集;阿爾茨海默病果蠅模型中,tau過表達導致circHps m6A富集升高4.2倍(Nature Neuroscience 2024)

※技術突破:首次實現環狀RNA m6A單堿基定位(RNase R耐受性驗證)

 

4. 骨科與植入物反應

·鈦顆粒誘導骨溶解:Lin等證實METTL3-m6A軸調控骨穩態:鈦植入后METTL3表達下降60%,導致GPR161等成骨基因m6A丟失(Biomaterials 2024)

※臨床價值:靶向METTL3可恢復骨形成能力(ALP活性提升3.1倍)

 

三、性能制勝:6維參數碾壓傳統方案

評估維度

傳統MeRIP

本試劑盒

分辨率

100-200 nt

單堿基

樣本通量

4樣本/天

24樣本/天

最低輸入量

1 μg

200 ng

抗體特異性

交叉反應率>30%

<5%

環狀RNA兼容性

不可檢測

可定位

臨床樣本成功率

60%(腫瘤組織)

95%

 

四、全流程解決方案:從實驗臺到病床旁

1. 基礎研究場景,多組學整合:

○ m6A-CUT&RUN + 單細胞測序 → 繪制肝癌微環境m6A圖譜(Zhou et al. 2022)

○ m6A富集 + 空間轉錄組 → 解析腦區特異性修飾(Atrian et al. 2024)

2. 轉化醫學場景

·靶點篩選:

○ 骨溶解患者樣本中篩選METTL3抑制劑(Lin et al. 2024)

○ 肝癌PDX模型驗證YTHDF3-PFKL靶向治療效果

·診斷標志物開發:

○ 巨噬細胞Socs1 m6A作為關節炎活動期指標(AUC=0.91)

 

五、未來生態:引領RNA表觀遺傳新紀元

1. 技術融合前沿

·動態修飾監測:聯合dPCR實現單細胞m6A修飾追蹤(果蠅神經模型)

·人工智能預測:基于SRAMP數據庫開發m6A編輯位點深度算法(Beclin1驗證準確率99.2%)

 

2. 臨床轉化管線,在研療法:

·METTL3激動劑(骨再生植入物涂層)

·YTHDF3-PFKL抑制劑(肝癌一線聯合用藥)

·ALKBH5-SOX9調控劑(男性不育癥基因治療)

 

全球實驗室的選擇:3000+研究機構的信任背書

從哈佛醫學院阿爾茨海默病中心 到中科院骨代謝重點實驗室,EpiQuik CUT&RUN m6A Kit 已成為Nature、Cell等頂刊研究的標配工具。超過97%的用戶反饋:“在微量樣本與復雜模型中的穩定性遠超同類產品”(2024年EpiGentek用戶調研)。


關鍵文獻技術應用匯總表(節選)

研究領域文獻樣本類型核心發現技術價值點
肝癌Zhou et al. 2022人源細胞系YTHDF3-PFKL糖酵解軸200 ng RNA檢測低頻靶點
生殖醫學Chen et al. 2023豬睪丸組織ALKBH5-SOX9調控精子發生首次應用于大型哺乳動物
神經退行Atrian et al. 2024果蠅頭部tau介導的環狀RNA m6A修飾突破環狀RNA檢測瓶頸
骨科Lin et al. 2024鈦顆粒刺激骨細胞METTL3-m6A-GPR161信號軸臨床樣本成功率100%


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