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Epigentek:EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit (P-2035-24)

發布者:艾美捷科技    發布時間:2025-07-07     
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EpiNext CUT&LUNCH.png

引言:當高效與精準成為科研剛需,你還在為傳統方法耗時耗力而煩惱嗎?

在表觀遺傳學研究中,解析蛋白質與 DNA 的相互作用(如組蛋白修飾、轉錄因子結合)是揭示基因表達調控機制的核心。然而,傳統 ChIP-seq 需要百萬級細胞投入、耗時數天,CUT&RUN 雖優化了樣本量,卻面臨非特異性切割和流程復雜的挑戰。如今,EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit (P-2035-24)以突破性的技術革新,重新定義蛋白 - DNA 互作研究的 “黃金標準”——1 小時 50 分鐘完成從細胞到靶標富集,2000 個細胞即可啟動實驗,特異性超越 CUT&RUN 1.7 倍,讓高分文章的數據采集不再受限于樣本與時間!


一、核心技術特點(Features):三大革新重塑實驗體驗

1、極簡三步流程,極速完成靶標富集

·無需 ConA 固定或復雜磁珠操作,直接從完整細胞開始,通過 “抗體結合 - 核酸酶切割 - 特異性回收” 三步,1 小時 50 分鐘內完成蛋白 - DNA 復合物的高效捕獲。

·技術亮點:獨特的核酸酶混合體系僅切割靶標區域兩端的 DNA,避免非特異性片段干擾,相比 CUT&RUN 省去 20 + 步驟,實驗重復性顯著提升。


2、超低樣本投入,解鎖稀有樣本研究

·僅需2000-500,000 個細胞(傳統 ChIP 需 100 萬 +)或新鮮 / 冷凍組織,即可實現基因組 - wide 蛋白 - DNA 互作分析。

·適用場景:臨床穿刺樣本、胚胎細胞、循環腫瘤細胞等稀缺樣本的深度研究,打破 “樣本不足” 的實驗瓶頸。


3、廣譜兼容性與高特異性設計

·兼容組蛋白修飾(如 H3K4me3、H3K9me3)與強結合轉錄因子,獨特酶切體系避免抗體非特異性結合導致的背景噪音。

·數據支撐:與 ENCODE 數據庫 ChIP-seq 數據對比,CUT&LUNCH 的峰型更銳利、背景更低,FRiP 值(靶標區域富集率)比 CUT&RUN 高 1.7 倍,精準定位 DNA 結合位點。

 

ChIP-seq.pngCUT&LUNCH.pngEpiNext CUT&LUNCH.png
試劑盒的示意圖流程CUT&LUNCH 在目標區域的信號富集度更高。CUT&LUNCH 的 FRiP 比 CUT&RUN 高 1.7 倍CUT&LUNCH 檢測 0.1 百萬 MCF-7 細胞組蛋白標記(H3K4me3 活躍區與 H3K9me3 沉默區)的峰譜,與 ENCODE 數據庫中 5 百萬 MCF-7 細胞 ChIP-seq 數據的峰分數分布高度一致。


二、技術優勢:為什么 CUT&LUNCH 是優于 CUT&RUN 和 ChIP 的選擇?


指標

CUT&LUNCH

傳統 CUT&RUN

ChIP

流程耗時

1 小時 50 分鐘

6 小時 - 2 天

4 小時 - 2 天

細胞投入量

2000-50 萬

5000-50 萬

10 萬 - 1000 萬

轉錄因子適用性

良好

較差(非特異性切割嚴重)

良好

背景噪音

5%(陰性 / 陽性對照比)

30%

20%

測序分辨率

高(單堿基級別)

中等

 

優勢解析:

·相比 CUT&RUN,CUT&LUNCH 通過 “兩端特異性酶切” 避免了 pAG-MNase 非偶聯抗體的隨機切割,尤其在轉錄因子研究中優勢顯著(如 Oct4、Sox2 等低豐度結合蛋白)。

·對比 ChIP,CUT&LUNCH 省去交聯、超聲破碎等損傷害染色質結構的步驟,保留天然互作狀態,且無需優化超聲條件,實驗成功率提升 90% 以上。


三、科研價值:你的研究將因它獲得哪些突破?

1、提速發文周期,搶占科研先機

·從樣本處理到 NGS 建庫僅需 1 天,比傳統方法縮短 3-5 天,助力快速驗證假設、搶占領域熱點(如癌癥表觀調控、發育生物學基因表達動態)。

·用戶案例:某高校團隊使用 CUT&LUNCH 分析 2000 個胚胎干細胞的 H3K27me3 修飾,2 周內完成測序與分析,成果發表于《Nature Communications》。


2、數據質量升級,助力高分期刊發表

·高特異性富集帶來更低的背景噪音和更尖銳的峰型,滿足《Cell》《Science》等頂刊對測序數據 “高信噪比” 的要求。

·實驗驗證:MCF-7 細胞中 H3K4me3 的 CUT&LUNCH 數據與 ENCODE 標準數據一致性達 92%,且峰寬縮小 40%,證明定位精度顯著提升。


3、降低實驗成本,優化資源分配

·試劑盒包含所有必需試劑(抗體、核酸酶、純化柱等),無需額外購買磁珠或酶類,單反應成本比 CUT&RUN 降低 50%。

·低樣本需求減少珍貴樣本浪費,尤其適合預算有限的課題組或多樣本平行實驗。

 

四、應用場景:從基礎研究到轉化醫學的全場景覆蓋

·表觀遺傳機制研究:組蛋白修飾圖譜繪制、染色質開放區域分析(配合 ATAC-seq);

·轉錄因子調控網絡:疾病相關轉錄因子(如 p53、NF-κB)的結合位點鑒定;

·癌癥標志物篩選:腫瘤細胞中異常甲基化組蛋白的富集與測序;

·藥物靶點發現:小分子化合物對蛋白 - DNA 互作的干預效果評估(如 HDAC 抑制劑作用機制)。

 

五、即刻行動:解鎖你的科研效率密碼

現在訂購 EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit(貨號 P-2035-24,24 次反應),所有產品均提供6 個月質量保證,搭配配套的 CUT&LUNCH Library Preparation Kit(貨號P-1058-24,24 次反應),輕松實現從富集到測序的全流程閉環。歡迎垂詢Epigentek中國區獨家代理,艾美捷科技!

 

結語:讓每一份樣本都發揮最大價值,讓每一次實驗都靠近科學真相

EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit,以技術創新打破科研瓶頸,讓 “高效” 與 “精準” 不再是單選題。無論你是追求高分辨率數據的資深研究者,還是初入表觀領域的科研新人,它都將成為你探索基因調控奧秘的得力助手 ——你的下一篇高分論文,或許就差這個 “極速富集” 的關鍵工具!

 


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