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品牌專題
我們提供最全面的染色質研究產品,涵蓋實驗流程的每一步,從上游到下游。借助EpigenTek的染色質研究產品系列,拓展您對染色質的理解:
什么是染色質免疫沉淀(ChIP)?
染色質免疫沉淀(ChIP)是研究染色質相關修飾最常用的方法之一。它是一種通過特定蛋白質與基因組DNA區域結合的過程。這種流行的ChIP實驗為表觀遺傳學研究人員提供了關于某些蛋白質或蛋白質修飾與特定DNA序列相互作用的寶貴信息。
蛋白質與DNA的相互作用對細胞功能至關重要,例如DNA復制和重組、基因轉錄、染色體分離、信號轉導以及表觀遺傳沉默。了解蛋白質與DNA的相互作用可用于比較兩個不同群體(如疾病組織和健康組織)中與特定基因啟動子區域相關的組蛋白甲基化水平。染色質免疫沉淀方法還可以用于繪制其他各種組蛋白修飾的基因組定位。
染色質研究步驟細節
1. 分離提取染色質
染色質是由DNA和蛋白質組成的復合體,它將DNA壓縮到更小的體積中以便容納在細胞內,幫助防止DNA損傷,并控制基因表達和DNA復制。正確分離染色質樣本是研究蛋白質-DNA相互作用實驗中的一個重要因素。EpiGentek的專利染色質分離試劑盒采用多種方法,確保從哺乳動物或植物細胞和組織中提取完整染色質的高質量分離。
貨號 | 名稱 | 描述 |
P-2001 | ChromaFlash Chromatin Extraction Kit 染色質分離提取試劑盒 | 從哺乳動物細胞或組織中分離完整的染色質 |
P-2022 | ChromaFlash Plant Chromatin Extraction Kit 植物染色質分離提取試劑盒 | 從植物細胞或組織中分離完整的染色質 |
P-2023 | ChromaFlash Chromatin Isolation & Shearing Kit 染色質分離和剪切試劑盒 | 用于簡單快速地從哺乳動物細胞或組織中分離染色質或dna-蛋白質復合物,然后通過超聲波進行剪切 |
2. 染色質可及性分析
染色質結構是基因調控的重要決定因素之一,而其中的關鍵因素是染色質對轉錄因子和其他DNA結合蛋白的可及性。一般來說,染色質越緊密,轉錄因子和其他DNA結合蛋白就越難以接近DNA并執行其功能。相反,DNA的可及性越高,周圍基因被積極轉錄的可能性就越大。研究染色質結構的可及性具有特別重要的意義,因為它可以提供有關核小體存在與否的信息,而核小體的存在與否會直接影響或間接影響一系列其他細胞和代謝過程。
貨號 | 名稱 | 描述 |
EpiQuik Chromatin Accessibility Assay Kit 染色質可及性分析檢測試劑盒 | 用于定量染色質分析以及確定常染色質或異染色質狀態。 |
3. 染色質免疫沉淀(ChIP)
由于蛋白質與DNA的相互作用在細胞功能中起著至關重要的作用,識別DNA結合蛋白的遺傳靶點并了解蛋白質-DNA相互作用的機制對于理解細胞過程至關重要。染色質免疫沉淀(ChIP)是研究人員用于研究這些相互作用的工具之一。ChIP相較于其他方法的優勢在于,它能夠在活細胞中檢測特定蛋白質與基因特定序列的結合。EpiGentek提供了一系列實驗試劑盒解決方案,幫助您的實驗室高效、準確且可重復地開展基于ChIP的實驗。
貨號 | 名稱 | 描述 |
P-2002 | EpiQuik Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Kit 染色質免疫沉淀(ChIP)試劑盒 | 從細胞樣本中特異性免疫沉淀染色質 |
P-2027 | ChromaFlash High-Sensitivity ChIP Kit 高靈敏度染色質免疫沉淀(ChIP)試劑盒 | 從少量哺乳動物細胞或組織中進行染色質免疫沉淀 |
植物染色質免疫沉淀(ChIP)試劑盒 | 從植物樣本中特異性免疫沉淀染色質 |
4.PCR/測序(ChIP-Seq)NGS分析
進一步推動這一過程,下一代測序(NGS)技術提高了數據產出量,并降低了ChIP測序的成本。ChIP-Seq將已經討論過的染色質免疫沉淀過程與下一代測序方法相結合,提供了一種有效的方法,用于識別轉錄因子和其他蛋白質的全基因組DNA結合位點。ChIP-Seq的優勢在于能夠在全基因組水平上解析目標蛋白結合位點的特定遺傳序列。實時定量PCR(RT-qPCR)則通過使用特異性引物進行選擇性擴增,分析修飾組蛋白和/或其他DNA結合蛋白在精確位點的結合位點,提供了一種替代方法。EpiGentek提供了多種經濟實惠的PCR和NGS解決方案,包括完整的試劑盒套餐,方便從低量或難以處理的樣本中構建高質量的DNA文庫。
貨號 | 名稱 | 描述 |
P-2030 | EpiNext ChIP-Seq High-Sensitivity Kit (Illumina) ChIP-Seq高靈敏度試劑盒(Illumina) | 用于低輸入細胞樣本的ChIP測序NGS文庫制備。
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P-1029 | EpiQuik Quantitative PCR Fast Kit 定量PCR快速試劑盒 | 用于染色質免疫沉淀(ChIP)的定量實時聚合酶鏈反應(PCR)分析。 |
5.CUT&RUN-Fast/CUT&TAG原位
染色質免疫沉淀(ChIP)是一種用于研究細胞中全基因組范圍內蛋白質/DNA相互作用的常用工具,通過富集目標組蛋白或轉錄因子復合的DNA,并通過下一代測序技術繪制相互作用區域。由于ChIP存在以下局限性:1)需要大量的起始材料;2)處理時間長;3)分辨率低,靶向切割與核酸酶釋放技術(CUT&RUN)應運而生,以解決這些問題。該技術在未經固定的完整細胞或細胞核中原位進行,通過pAG-MNase融合蛋白在特定抗體占據位點處切割染色質,并釋放蛋白質/DNA復合物。與ChIP相比,CUT&RUN具有諸多優勢,包括需要的起始材料少、分辨率更高。該技術采用了一種新穎且獨特的核酸酶混合物,具有低序列偏好性,能夠同時對染色質進行片段化,并在目標蛋白/DNA復合物的兩端切割/移除任何DNA序列,而不影響目標蛋白占據的DNA,從而提高了特異性和分辨率。
貨號 | 名稱 | 描述 |
P-2028 | 對于從低輸入細胞/染色質中富集蛋白質的特定DNA復合物,通過NGS鑒定或繪制體內蛋白質-DNA相互作用 | |
P-2032 | 用于從低輸入細胞/染色質中富集蛋白質特異性DNA復合物,并使用Illumina平臺制備NGS文庫 |
6. CUT&LUNCH
EpigenTek進一步改進了CUT&RUN方法,推出了新的CUT&LUNCH(靶向切割與均勻釋放獨特核酸復合物)技術,該技術具有極快的實驗流程、進一步增強的特異性以及最小化的背景信號。
CUT&LUNCH實驗的簡化流程能夠讓您快速選擇性富集目標蛋白/DNA復合物。快速的三步實驗流程可在不到2小時內完成,最大限度減少細胞核損傷和染色質丟失,同時保留天然染色質結構:
第一步:抗體與目標結合(30分鐘)
第二步:酶切割(10分鐘)
第三步:選擇性回收與純化(60分鐘)
貨號 | 名稱 | 描述 |
P-2035 | EpiNext CUT&LUNCH Assay Kit | 用于目標蛋白- dna復合物的超快速、高特異性富集 |
P-2033 | EpiNext cTIP (CUT&Tag In-Place)-Sequencing Kit | 用于超快速,高特異性富集目標蛋白- dna復合物與文庫準備一體化 |
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